蛋白质的修饰这一领域已成为全球生物医学界关注的焦点。除了一些传统的磷酸化和泛素化，硝基化、乙酰化、SUMO化引发关注外，还有一些修饰策略，如PEG化修饰、脂质体化、糖基化，这些复杂的调控作用在众多慢性疾病（退行性疾病、代谢性疾病、肿瘤、心血管、内分泌等）以及一些炎症等中都起到关键调控作用。通过对蛋白质修饰的调控和反调控可能给众多临床疾病的诊断和治疗带来契机。以下是一些蛋白质修饰在癌症方面的研究的进展。

乳腺癌是女性常见的恶性肿瘤，其发病率正逐年上升，严重威胁着妇女的健康和生命，也给社会和家庭带来巨大的财产损失和精神痛苦。乳腺癌的发生有多种因素，如家族史、生殖因素、生活方式、饮酒、雌激素暴露等等。其中，暴露于雌激素被认为是乳腺癌的主要原因。雌激素受体α（ERα）是乳腺癌发生、发展过程中重要的调节因子，在近70%的乳腺癌中高表达。临床上，ERα是一个良好的乳腺癌诊断和治疗的生物学标志物，也是乳腺癌治疗中一个重要的靶点。因此，鉴定出对ERα具有调节功能的分子可以促进乳腺癌治疗策略的发展。大连理工大学生命学院伍会健教授课题组研究发现抑制ERα的转录活性的一种负调控因子可SUMO化，这对阐述ERα介导的乳腺癌发生发展的分子机制具有重要意义，也为ERα介导的疾病的治疗开辟了新的思路。

骨髓瘤是一种浆细胞癌症，是一种最普遍的血液癌症，大概占所有癌症总数的1％。早些年多发性骨髓瘤的常规和标准治疗方法是化疗和自体同源干细胞移植。然而随着新的药物靶点的发现，更多的新药被开发用于治疗骨髓瘤。包括bortezomib、thalidomide和相应的免疫调节药物(IMiDs)。临床研究表明，bortezomib和IMiDs联用可以有效地提高多发性骨髓瘤患者的存活率，并用来治疗经单一药物治疗后复发的患者。近期研究揭示了IMiDs用来治疗多发性骨髓瘤的机制。IMiDs被发现能和CRL4A泛素连接酶的一个接头蛋白CRBN结合，从而激活CRL4ACRBN泛素连接酶的活性来靶向并泛素化降解B细胞特异性的两个转录因子IKZF1和IKZF3，而IKZF1和IKZF3对骨髓瘤细胞的存活至关重要。Bortezomib和IMiDs联用能取得更好的临床效果，但是bortezomib作为一种蛋白酶体抑制剂，它能抑制IMiDs所诱发的IKZF1/3降解，理论上抑制IMiDs的作用。所以这就存在一个矛盾。浙江大学生命科学研究院仓勇教授实验室研究中发现当CRBN不和CRL4A泛素连接酶结合时，它本身是不稳定的，能被另一个泛素连接酶SCFFbxo7泛素化降解。所以在骨髓瘤细胞中，bortezomib能稳定CRBN的水平，使更多的CRBN与CRL4A泛素连接酶结合，促进IMiDs所诱发的IKZF1/3的降解，从而产生对骨髓瘤细胞的协同抑制作用。对蛋白质泛素化的深入研究为临床上更好地使用bortezomib和IMiDs达到最大化的治疗效果提供了机制上的框架指导。

蛋白质酪氨酸硝基化是一种化学性质稳定的氧化损害的标志物，该修饰主要由体内亚硝酸盐途径产生，也可以由髓过氧化物酶和其它过氧化物酶反应途径产生。硝基化产生于生理条件下、富集于病理条件下、参与氧化还原系统，并且该修饰可通过酶和非酶机制而逆转。中南大学湘雅医院詹显全教授课题组研究发现蛋白质酪氨酸硝基化不仅是氧化应激的生物标志物，而且也通过调节和改变蛋白质的功能参与多种疾病的病理生理过程，如肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、炎症性疾病等。