杭师大:miRNA调控水稻叶片衰老
水稻(Oryza sativa L.)生产是保证人类粮食安全的首要任务。提高粮食产量的途径之一是延缓叶片衰老,并延长光合作用时间。MicroRNAs(miRNAs)是真核生物衰老和细胞衰老的关键调节因子。近日杭州师范大学沈波教授的团队携手中国水稻研究所庄杰云教授的团队系统研究了miRNAs在水稻叶片衰老过程中发挥的作用*,研究成果发表在12月刊的PLoS ONE上。
科研人员采用高通量测序技术对两个不同株系的超级杂交稻(N2Y6,抗衰老稻和LYP9,易衰老稻)叶片构建并测定了6个小RNA文库,6个DGE文库,和2个降解组文库(小RNA测序,DGE测序和降解组测序项目均由联川生物承担完成)。 接着基于这些测序数据,对两个不同品种的杂交稻的miRNA和其靶基因进行深入分析。实验共鉴定出,372个已知miRNAs,162个候选miRNAs,和1145个miRNA靶基因。相比于LYP9叶片中miRNA的表达,在N2Y6叶片中,在灌浆初期分别有47个和30个miRNAs,在中期分别有21和17个miRNAs,在后期分别有11和37个miRNAs出现上调和下调。鉴定出6个miRNA家族,osa-miR159,osa-miR160,osa-miR164,osa-miR167,osa-miR172和osa-miR1848,分别靶向编码AP2,锌指蛋白,水杨酸诱导蛋白19(SIP19),生长素响应因子(ARF)和NAC转录因子的基因,发现这些miRNAs可通过植物激素信号转导通路参与调控叶片衰老。
此项研究成果为理解miRNA介导水稻叶片衰老提供了重要信息,并为水稻育种奠定了重要基础。
*Xu X,Bai H,Liu C,Chen E,Chen Q,et al. (2014) Genome-Wide Analysis of MicroRNAs and Their Target Genes Related to Leaf Senescence of Rice. PLoS ONE 9(12): e114313.[article]
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