mNGS在诊断血流感染方面优于常规微生物检测
摘要:mNGS检出率明显高于CMT,mNGS检出了187例感染病例,CMT检出了81例。结果表明mNGS在检测血流感染方面优于CMT。
一项发表在《Journal of Infection》杂志上的研究调查了宏基因组新一代测序(mNGS)在诊断免疫功能低下的血液病患者的血流感染(BSI)中的应用。这篇论文的通讯作者是华中科技大学同济医学院附属同济医院的高丽丽。
血液病患者极易发生血流感染,这种感染可能导致严重后果,比如脓毒性休克、多器官衰竭、弥散性血管内凝血,甚至死亡。因此,对血流感染进行准确快速的微生物学诊断对于控制感染至关重要。
图1 研究调查了宏基因组新一代测序(mNGS)在诊断免疫功能低下的血液病患者的血流感染(BSI)中的应用
这项研究于2019年1月至2020年12月在同济医院进行,华大基因研究人员张文倩也参与了这项研究。研究人员从256名怀疑患有BSI的免疫功能低下血液病患者中收集了外周血样本,并开展了mNGS和常规微生物检测(CMT)。
在256例患者中,189例(73.8%)确诊血流感染。其中,mNGS检出率明显高于CMT,mNGS检出了187例感染病例,CMT检出了81例。结果表明mNGS在检测血流感染方面优于CMT。
17例患者(6.6%)检测到细菌,15例患者(5.9%)检测到真菌,4例患者(1.6%)检测到罕见病原体,且55例患者(21.5%)检测到多种病原体。
根据mNGS的结果,病毒感染是最常见的血流感染原因, 256例患者中有96例(37.5%)确诊。5种最常见的致病病毒分别为巨细胞病毒(31.3%)、EB病毒(14.8%)、单纯疱疹病毒1型(11.7%)、BK病毒(11.7%)和人类疱疹病毒6B(9.4%)。
结果还表明,接受过造血干细胞移植的患者比未接受过移植的患者更容易感染BK病毒和人类疱疹病毒HHV6B。
总的来说,这项研究强调了mNGS的潜力,它可作为快速准确的工具来诊断免疫功能低下的血液病患者的血流感染,从而实现及时有效的治疗。
参考资料:
[1]Application of metagenomic next-generation sequencing in bloodstream infection regarding immunosuppression
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